AtomEye е атомистичен софтуер за визуализация достатъчно бърз, за ​​да се справи с изхода на симулации на молекулярна динамика с милиони атоми.Тя включва паралелни и перспективни проекции с пълна триизмерна навигация, изчисляване на персонализирани връзки и координационни номера, цветово кодиране на произволни дефинирани от потребителя количества, локален авариен инвариант на щам, оцветяване и проследяване на атома, до 16 равнини на рязане, периодично гранично състояниепреводи, екранни снимки на JPEG, PNG и EPS и скриптове за анимация ....