BioBlender е софтуерен пакет, изграден върху софтуера за 3D моделиране с отворен код.Биологията работи на наноразмер, с обекти, невидими за човешкото око.С BioBlender е възможно да се покажат някои от героите, които населяват нашите клетки, въз основа на научни данни и най-високия стандарт на 3D манипулация.Учени от цял ​​свят изучават протеини на атомно ниво и депозират информация в публичното хранилище Protein Data Bank, където всяка молекула е описана като списък на нейните атоми и техните 3D координати .... С потребителите на BioBlender могат да се справят с протеините в триизмерното пространство, показващи повърхността си по фотореалистичен начин и изработват протеинови движения въз основа на известни конформации.PDB файловете могат да бъдат зареждани от дефинирана от потребителя директория или да бъдат изтеглени директно от PDB сайта (чрез поставяне на PDB кода).Протеинът се показва в 3D (като атоми или молекулна повърхност) и потребителят може да изчисли и визуализира неговите повърхностни свойства, Molecular Lipophilic Potential и Electrostatic Potential.За движение на протеини BioBlender изчислява междинни продукти между две конформации, използвайки Blender Game Engine.Програмата дава като изход както междинните PDB файлове, така и изобразените изображения като филм.BioBlender е внедряване на Blender, отворен код, свободно разпространяваща се, многоплатформена, оперативно съвместима и поддържана програма за 3D анимация, визуални ефекти и видео игри.Комбинацията от 3D компютърна графика, игра на двигателя и научни програми, правят BioBlender цялостен инструмент за усъвършенстване на движението на протеини и за показване на техните повърхностни характеристики, използвайки визуален код, базиран на текстуриране и специални ефекти на частиците.По този начин е възможно да се покажат физическите и химичните свойства на молекулата в движение.BioBlender е резултат от сътрудничество, ръководено от групата SciVis към CNR в Пиза (Италия), между учени от различни дисциплини (биология, химия, физика, компютърни науки) и