MSYS е колекция от помощни програми за GNU като bash, make, gawk и grep, за да позволи изграждането на приложения и програми, които зависят от традиционните UNIX инструменти.Той е предназначен да допълни MinGW и недостатъците на обвивката на cmd.Пример за това е изграждането на библиотека, която използва системата за изграждане на autotools.Потребителите обикновено изпълняват "./configure", след което "правят", за да го построят.Скриптът за конфигуриране на черупки изисква интерпретатор на скриптове за черупки, който не присъства в системите на Windows, но се предоставя от MSYS ....